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日期: 2020-02-01 | 來源: 澎湃新聞 | 有20人參與評論 | 專欄: 新冠疫情 | 字體: 小 中 大
當地時間1月30日,國際頂級醫學期刊《柳葉刀》在線發表最新論文,揭示新型冠狀病毒(2019-nCoV)的基因組序列與SARS-CoV的差異很大,可以被認為是壹種新型的人類感染性乙型冠狀病毒。不過該病毒的原始宿主與SARS-CoV相同,都是蝙蝠。
同時,論文發現新型冠狀病毒進入人類細胞所使用的分子“通道”,即人類的受體,可能也與SARS病毒相同,都是血管緊張素轉化酶2(ACE2)。
值得注意的是,論文還披露了4個細節:
第壹,疫情的首次報告是在2019年12月下旬,此時武漢的大多數蝙蝠都在冬眠。
第贰,在華南海鮮市場上未發現有蝙蝠或出售蝙蝠,但是有許多包括哺乳動物在內的非水生動物。
第叁,2019-nCoV與它的近親bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21 之間的基因序列相似度不到90%,這意味著這兩種源於蝙蝠的冠狀病毒並不是2019-nCoV的直接祖先。
第肆,在SARS和MERS中,蝙蝠都是其自然宿主,另壹種動物作為中間宿主,而人類作為最終宿主。
該研究在取自患者的全部10份基因樣本中均發現了2019-nCoV,包括8個完整基因組和2個部分基因組。各樣本的基因序列幾乎完全相同(超過99.98%的基因序列相同),這表明該病毒是最近才侵染人類。
論文通訊作者之壹、山東第壹醫科大學、山東省高等學校新發傳染病病因流行病學實驗室史衛峰教授表示,“值得關注的是,本研究發現來自不同患者的2019-nCoV病毒基因序列幾乎相同。這壹發現說明,分離得到的2019-nCoV起源於同壹來源,傳播發生的時間還很短,並被相對迅速地檢測出來。但是,隨著病毒傳播給更多的人,對突變的發生進行不斷的監測是有必要的。”
該論文來自中國疾病預防控制中心、山東大學、山東第壹醫科大學和山東醫學科學院、湖北省疾病預防控制中心、深圳華大因源醫藥科技有限公司、中國科學院、解放軍總醫院、溫州醫科大學、悉尼大學、山東第壹醫科大學附屬第壹醫院的研究人員。
樣本采自9人,1人住海鮮市場附近酒店
論文從9名住院患者的支氣管肺泡灌洗液和培養分離物樣品進行了測序。
研究者表示,對這些2019-nCoV基因組和其他冠狀病毒基因組進行的系統進化分析是為了確定該病毒的進化史,同時幫助推斷其可能的起源。為了探索病毒可能的受體結合特性,研究者進行了同源性建模。

九名感染了2019新型冠狀病毒的患者的樣本信息
9名患者患有病毒性肺炎,並且常見呼吸道病原體呈陰性,去了至少叁家位於武漢的醫院就診。他們中的8人在出現症狀之前去過華南海鮮市場,另壹人(WH04)沒有去過市場,但於2019年12月23日至12月27日住在市場附近的酒店。
9人中的5人(WH19001、WH19002、WH19004、WH19008、YS8011)的樣本由中國疾控中心(CDC)收集,CDC對樣本進行測試,均對所有篩查的常見呼吸道病原體呈陰性。
其余4名患者(WH01、WH02、WH03、WH04)的樣本由華大基因采集,檢測結果顯示對常見呼吸道病原體也均為陰性。
通過分析9名患者的樣本,研究者獲得了2019-nCoV的8個完整的和2個部分的基因組序列。
這些數據已保存在中國國家微生物數據中心(登錄號NMDC10013002,基因組登錄號NMDC60013002-01至NMDC60013002-10),而華大基因的數據已保存在中國國家基因庫(登錄號CNA0007332–35)。
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