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日期: 2020-03-29 | 來源: 澎湃 | 有0人參與評論 | 專欄: 新冠疫情 | 字體: 小 中 大
早在2019年12月之前，新冠病毒可能已經在在人群“隱秘傳播”（cryptic spread）階段發生了壹些關鍵突變。也就是說，這種新型病毒在人群中出現的時間可能比設想的更早，甚至不壹定最早出現在武漢。
上述推測結論來自兩位病毒學專家：澳大利亞悉尼大學瑪麗·巴希爾傳染病和生物安全研究所的愛德華·霍爾姆斯（Edward C. Holmes）教授，以及中國疾控中心（CDC）傳染病預防控制所研究員、復旦大學附屬上海市公共衛生臨床中心兼職教授張永振。當地時間3月26日，這兩位“老搭檔”聯合在頂級學術期刊《細胞》（CELL）上發表了壹篇評論“A Genomic Perspective on the Origin and Emergence of SARS-CoV-2”。
霍爾姆斯為這篇文章的通訊作者。官網簡歷顯示，他擅長研究傳染病的進化和出現，特別是RNA病毒跨越物種界限在人類和其他動物中出現的機制。他同時也是中國疾控中心的客座教授，以及復旦大學的名譽客座教授。值得壹提的是，張永振和霍爾姆斯長期保持著學術合作，其合作團隊在《自然》等學術期刊上發表多項成果。他們兩人在多年前還到訪過這場疫情的假設起源地之壹——武漢華南海鮮市場。
在此次疫情尚不為外界警覺時，即2019年12月26日，張永振、霍爾姆斯等人獲得了武漢中心醫院壹名患者的病毒樣本。1月5日凌晨，研究團隊從樣本中檢測出壹種新型SARS樣冠狀病毒，通過高通量測序獲得了該病毒的全基因組序列（GenBank：MN908947），並立即報告了相關部門。1月11日，研究團隊在病毒學網站（virological.org）發布了所獲得的新型冠狀病毒全基因組序列，系全球最早公布該病毒序列的團隊。
張永振、霍爾姆斯此次在《細胞》的這篇評論文章中，將他們對這場新疫情致病病原體的鑒定，這種新冠狀病毒和其他冠狀病毒的比較，以及這種人畜共患病何時在人群中悄然出現等問題，均進行了描述和分析。
他們代表了參與新冠病毒初始基因組測序工作的最早壹批科學家，試圖厘清其起源脈絡。
壹種新的病毒出現：為何傳播更快？
此次疫情臨床病例開始出現後，張永振等人即試圖確定致病病原體的基因組序列。他們的研究對象來自2019年12月26日入住武漢中心醫院的壹名患者，當時已經發病6天。該患者出現發熱、胸悶、咳嗽、疼痛和虛弱，伴有肺部異常提示肺炎，這些症狀隨後在COVID-19中很常見。
作者們在2020年1月5日獲得壹個完整的病毒基因組。初步分析表明，該病毒與SARS樣病毒（冠狀病毒科）密切相關。他們立即將這壹結果報告給了相關部門，並在同壹天向NCBI/GenBank提交了基因組序列（Wuhan-Hu-1毒株）。隨後，在愛丁堡大學Andrew Rambaut博士的幫助下，作者們於2020年1月11日在開放獲取病毒學網站（http:// virological.org/）上公布了該病毒的基因組序列。隨後，中國疾控中心在公眾訪問GISAID數據庫(https://www.gisaid.org/)發布了新冠病毒基因組序列，以及相關的流行病學數據。- 新聞來源於其它媒體，內容不代表本站立場！
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